انتقد الدكتور سيف الدين عبدالفتاح، أستاذ العلوم السياسية تصريحات وزارة الداخلية بحكومة الانقلاب حول استخدام جماعة الإخوان لأموال الزكاة فى تمويل عملياتهم الإرهابية بحسب كلام الوزارة، قائلا: "سماجة وتناحة وبجاحة".
وعلق عبد الفتاح فى تدوينة عبر صفحته على "فيس بوك": "عشان كده همه عاوزين يجمعوا الزكاة عن طريق شيخ الأزهر.. ويصرفوها على قتل المتظاهرين وفض المظاهرات.. وأدوات التعذيب فى السجون".
كان اللواء هانى عبد اللطيف المتحدث الرسمي باسم وزارة الداخلية بحكومة الانقلاب صرح، بأن "قطاع الأمن الوطني رصد صدور تكليفات من قيادات التنظيم الدولى للإخوان لعناصر التنظيم داخل مصر بسرعة توفير الدعم المالى اللازم لتنفيذ مخططات التنظيم التخريبية، وذلك من خلال الإيرادات المالية التى ترد إلى المؤسسات والجمعيات الأهلية ولجان الزكاة التى مازالت تسيطر على إدارتها الخلايا النائمة من تنظيم الإخوان، على حد وصفه.